De door de Zweedse onderzoekers ontwikkelde moleculaire methode ‘5PSeq’ is eenvoudig te gebruiken en is gebaseerd op de sequentiebepaling van boodschapper-RNA (mRNA) dat de bacteriën afbreekt bij de synthese van eiwitten. De metingen laten zien hoe de bacteriën worden beïnvloed door verschillende omgevingsfactoren, zoals antibioticabehandelingen en andere soorten stress.
“We hopen dat dit een van de vele instrumenten kan zijn die artsen nodig hebben om antibioticaresistentie, een ernstig en groeiend probleem, aan te pakken”, aldus hoofdonderzoeker Vicent Pelechano, universitair hoofddocent aan de afdeling Microbiologie, Tumor- en Celbiologie van het Karolinska Institutet in een persbericht.
Snelle test voor klinisch gebruik
De onderzoekers testten de methode op 96 bacteriesoorten van verschillende phyla in complexe klinische monsters, bijvoorbeeld uit fecaliën en de vagina, maar ook in compostmonsters. Al na enkele minuten konden zij zien of de bacteriën al dan niet reageerden op een antibioticabehandeling; het effect was het duidelijkst na ongeveer een half uur.
3N Bio is een bedrijf dat Pelechano en zijn collega’s hebben opgestart om de methode verder te ontwikkelen en een snelle moleculaire test voor klinisch gebruik te ontwikkelen. Ze hebben nu financiering gekregen van de Zweedse Onderzoeksraad om in samenwerking met het Karolinska University Hospital proof of concept voor een test aan te tonen.
“Het is van cruciaal belang dat artsen snel de juiste antibiotica kunnen vinden voor ernstig zieke patiënten met bacteriële infecties om het onnodige gebruik van antibiotica te verminderen,” zegt Pelechano. “De huidige methoden om antibioticaresistentie te testen kunnen uren of zelfs dagen duren, maar vaak moet er sneller worden behandeld om ernstige gevolgen voor de patiënt te voorkomen. Hierdoor wordt vaak een breedspectrumantibioticum voorgeschreven, wat het risico op resistentie vergroot.”