Dossier Covid-19

De uitbraak van het coronavirus Covid-19 is officieel een pandemie. Maar de geschiedenis heeft ons geleerd dat juist op die momenten de mensheid tot creatieve oplossingen komt. Daarover bericht Innovation Origins dagelijks in het Dossier Covid-19.

De Oostenrijkse start-up Innophore gaat twee miljard potentiële werkzame stoffen screenen op Covid-19. Dit is het grootste computergebaseerde screeningsproject ter wereld. Dit wordt mogelijk gemaakt door de samenwerking met Google en Harvard Medical School.

Covid-19 verspreidt zich in razend tempo. De zoektocht naar een geneesmiddel is een race tegen de tijd. De ontwikkeling van nieuwe werkzame stoffen is tijdrovend vanwege de noodzakelijke goedkeuringsprocedures. Daarom zijn er hogere verwachtingen van de screening van bestaande werkzame stoffen die de goedkeuringsprocedures al hebben doorlopen. Deze kunnen dan veel sneller in de praktijk worden gebruikt.

Innophore zorgde eind januari al voor een sensatie toen het in zeer korte tijd voorstellen kon doen voor geschikte bestaande werkzame stoffen tegen Covid-19. De basis was de zoekmachine op basis van Big Data en kunstmatige intelligentie, die snel en kostenefficiënt enzymen en actieve ingrediënten kan vinden. Intussen zijn ook andere veelbelovende werkzame stoffen geïdentificeerd.

Toch heeft het nieuwe screeningsproject een groot potentieel om nog meer geschikte kandidaten te vinden, aldus professor Arthanari van de Harvard Medical School. Het gerenommeerde onderzoeksinstituut draagt zijn onlangs gepubliceerde Virtual Flow methode bij aan het project. De computergestuurde methode maakt het mogelijk om individuele werkzame stoffen te screenen op hun mogelijke werkzaamheid.

Enorme hoeveelheden gegevens

De zoekmachine van Innophore ondersteunt het Virtual Flow proces van Harvard door talloze uitgangspunten te simuleren met de gepatenteerde 3D-puntwolktechnologie en deze te filteren met behulp van kunstmatige intelligentie. Zoals professor Arthanari opmerkt, is de combinatie van 3D-puntenwolktechnologie met grootschalige virtuele screening en de enorme rekenkracht veelbelovend.

Volgens Christian Gruber, CEO van Innophore, vormen de simulaties twee grote uitdagingen: Het verkrijgen van de gegevens voor de twee miljard werkzame stoffen en de benodigde rekencapaciteit. Hij gaat momenteel uit van 100 miljard individuele simulaties. Elk potentieel actief ingrediënt zou individueel worden gescreend.

Het omgaan met de grote hoeveelheden data wordt mogelijk gemaakt door het moederbedrijft van Google Alphabet, dat onbeperkte rekenkracht vrijgeeft vanuit de Google cloud. Het Vienna Scientific Cluster, een samenwerkingsverband van verschillende Oostenrijkse universiteiten, stelt ook capaciteit van zijn supercomputers ter beschikking.

Andere projectpartners zijn de Universität Graz en het Austrian Center of Industrial Biotechnology (acib).

Lees ook: Innophore ontdekt bestaand medicijn tegen corona